格格党

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第213章 计算生物学研究 四（第1页）

接下来的两周，徐辰和刘伟成了实验室里的“黄金搭档”

。

徐辰负责设计实验方案，计算加样量和时间点；刘伟则负责具体的湿实验操作。

刘伟不愧是博五的“资深科研狗”

，操作手法嫻熟无比。

“质粒构建，gibson组装体系，50度反应15分钟。”

刘伟一边念叨著，一边用移液枪精准地吸取微量的dna片段。

他的手很稳，枪头悬停在离液面0.1毫米的地方，轻轻一压，液体便如丝般滑入。

“转化感受態细胞，冰浴30分钟，42度热激90秒，復甦1小时。”

……

然而，实验並不总是一帆风顺的。

第三天，第一批转化结果出来了。

“徐神，情况不对。”

刘伟拿著培养皿，眉头紧锁，“这批菌落长得太慢了。

按照你的设计，我们用的是弱启动子来压低pfk的表达量。

但是现在看来，压得太狠了，菌体好像……快饿死了。”

徐辰接过培养皿，对著光看了看。

確实，上面的菌落细小如针尖，几乎看不见。

“不应该啊。”

徐辰调出模型数据，“根据奇异摄动理论的计算，35%的活性是临界点。

只要高於这个值，糖酵解通量应该能维持基本的生存需求。”

“除非……”

徐辰的目光突然变得锐利，“除非我们忽略了什么。”

他迅速打开电脑，重新检查了一遍那个庞大的微分方程组。

几分钟后，他猛地一拍大腿。

“大意了！

我忽略了『渗漏表达！”

徐辰指著屏幕上的一行参数，有些懊恼地说道：“我用的这个启动子，虽然理论强度是弱的，但在大肠桿菌的实际环境中，它会有一定的基础渗漏。

也就是说，即使我不加诱导剂，它也会偷偷地表达一点点酶。”

“而在我的模型里，我假设它是完美的开关。

这就导致实际的酶活性比我计算的要高，反而触发了细胞的负反馈调节，把整个通路给锁死了。”

徐辰在心里狠狠地吐槽了自己一句：这就是数学家的傲慢啊。

总以为世界是完美的球体，结果现实却是个坑坑洼洼的土豆。

生物系统里的噪音，有时候比信號还大。